我的狗狗缺氧如何治疗？
首先，很遗憾没有机会见到这只狗狗了。 就楼主的描述来看，其实已经能大致的判断出小狗当时的情况及现在的状况： 小狗刚出生，被羊水呛到，鼻子不通气，出现呼吸困难、心率加快；经过处理后，呼吸恢复正常，但仍有轻微咳嗽。
建议楼主再仔细回忆一下当时的处理过程和现在的小狗状况（如吃喝拉撒睡），以便更好的判断该用什么方法来医治。
下面是我个人的一些看法和建议： 在没见到小狗狗之前，不能乱用药。 如果楼主确定小狗狗的病情是因为呼吸道不畅而导致的，可以采用如下措施：
1.把温热的毛巾敷在它的鼻子上，或者用热毛巾擦他的鼻子。注意温度，过烫会烫伤狗狗的皮肤。 2.如果毛巾效果不明显，就用滴鼻净之类的东西给狗狗点一点，让它打喷嚏，将鼻腔内的异物排出即可。 3.如果以上的方法还不奏效，可考虑进行雾化治疗，但是这种方法只对呼吸道疾病有效，且费用较高，不建议使用。 4.如果是幼犬，可用生理盐水清洗口腔，然后用棉签轻轻清理喉咙和气管中的异物，尽量使其通畅些。 5.最后，一定要注意给狗狗保暖。 6.如果上述的措施都无效的话，则要考虑是否属于先天性心脏病之类的疾病，这种就要赶紧带去医院救治了。。。
以上是个人意见，希望有所帮助~
补充：关于心脏病的诊断与治疗方法 可参考以下资料：